Запись на мастер-классы 27-ой школы-конференции «Биология - наука 21 века» (Пущино, 22-25 апреля 2024 г)❗
Дорогие друзья!
Уже завтра закроется регистрация на нашу конференцию, не упустите последний шанс принять участие.
По результатам обратной связи от участников прошлого года мы вдвое увеличили количество мастер-классов! А это значит, что каждый найдет, чем заняться на мероприятии.
Вас ждут:
1. Знакомство с ЯМР метаболомикой
Кратко познакомимся с методом ЯМР спектроскопии и получим спектр образца сыворотки крови. Далее мы возьмём набор уже готовых ЯМР спектров, обработаем их, выполним статистический анализ на языке программирования R с получением красивых картинок, и, наконец, сделаем биологические выводы!
2. Высокопроизводительное нанопоровое секвенирование
Покажем, как готовить «библиотеку» для одного из самых миниатюрных приборов для расшифровки последовательности ДНК - MinION. Рассмотрим теоретические основы процесса, пройдем через основные его этапы на практике и закончим загрузкой «библиотеки» в проточную ячейку, после чего запустим прибор. Сборка геномов и последующий биоинформатический анализ. На примере прочтений, полученных после секвенирования древней бактерии, узнаем, как восстановить из них геном при помощи различных алгоритмов, и рассмотрим пути анализа имеющегося генома.
3. Гибкий докинг на ноутбуке
Докинг часто рассматривают как один из важнейших этапов в конструировании новых лекарств. При этом часто представляется, что этот метод требует особенно мощных компьютерных ресурсов. На нашем мастер-классе мы познакомим аудиторию с методологической основой докинга, поделимся программами, и вы сможете своими руками подготовить и запустить расчет. На своём ноутбуке! Полученные результаты будут здесь же проанализированы и подготовлены к публикации.
4. Хроматографические методы очистки белков
Рассмотрим теоретические основы разделения различных белков с использованием методов жидкостной хроматографии, а также при помощи аффинной хроматографии проведем очистку лактазы, которая способна окислять красители.
5. Биологическая цветометрия – новая область биофизики
Проведем практическую работу с цифровыми спектрофотометрами Eye-One Pro 1 и 2 (компания GretagMagbeth) для определения спектральных и цветовых параметров поверхности живых растений и животных.
6. Электронная микроскопия биологических объектов
Поговорим о просвечивающей электронной микроскопии, её задачах и основных отличиях от световой микроскопии. Расскажем о стадиях подготовки и съёмки биологических образцов, а также покажем рабочие места и оборудование для выполнения каждой части эксперимента. Познакомим с электронным микроскопом и посмотрим с его помощью образец ткани.
7. Рентгенофлуоресцентный анализ биокостных веществ
Вы познакомитесь с особенностями определения химических элементов в составе почв и геологических отложений с помощью РФА. Научитесь самостоятельно выполнять пробоподготовку и проводить измерения.
8. Мониторинг внутриклеточных сигнальных процессов с помощью генетически кодируемых флуоресцентных сенсоров
Познакомимся с сигнальными процессами в клетках млекопитающих. Понаблюдаем за основными путями внутриклеточного усиления сигнала с помощью флуоресцентной микроскопии.
9. Регистрация электрической активности одиночных клеток методом patch-clamp
Познакомимся с основами метода patch-clamp. Изготовим микропипетку, установим гигаомный контакт с одиночной клеткой, измерим её токи и установим их природу.
10. Методы секвенирования и сборки бактериальных геномов. Оценка микробного разнообразия почвенных сообществ методом полнометагеномного секвенирования
Узнаем об основных технологиях секвенирования нового поколения, а также этапах работы с полученными данными. Будут рассмотрены методы сборки геномов из коротких прочтений (MGI, Illumina), длинных (ONT) и гибридную сборку двух типов данных. Рассмотрим основные способы работы с данными секвенирования полных метагеномов почвенных микробиомов, начиная от контроля качества сырых данных и заканчивая сборкой метагеном-собранных геномов и созданием интерактивных схем. Научимся выполнять таксономическую классификацию метагеномов микробиома и оценивать представленность интересующих метаболических путей в них.
11. Выделение плазмид с помощью щелочного лизиса и очистки на спин-колонках
Вы познакомитесь с методикой выделения плазмидной ДНК, которая используется практически всеми генными инженерами.
12. Флуоресцентная микроскопия микроорганизмов
Узнаем о принципах и методах флуоресцентной микроскопии, об особенностях пробоподготовки микроорганизмов для просмотра во флуоресцентном микроскопе. Покрасим дрожжи и бактерии флуорохромами (красителями) для специфического выявления различных компартментов клетки. Полученные результаты посмотрим на микроскопе в реальном времени: проницаемость мембран живой или мертвой клетки, особенности в строении и разницу между оболочками у дрожжей и бактерий, прижизненное связывание красителя с нуклеиновыми кислотами.
13. Выделение ДНК и РНК из бактерий
Расскажем и покажем, как выделить ДНК и РНК в большом количестве.
14. Знакомство с бактериальными бактериолитическими ферментами
Предлагается погрузиться в невероятный мир бактерий-«хищников». С помощью своего оружия (бактериолитические ферменты и внешнемембранные везикулы) эти бактерии не оставляют ни единого шанса своим конкурентам в борьбе за существование. Будет рассказано, какие подходы (биохимические, молекулярно-генетические) используются для выделения новых бактериолитических ферментов. Будет продемонстрирован один из методов хроматографии - гель-фильтрация на современном приборе. Можно будет увидеть в режиме реального времени разделение смеси белков.
15. Самостоятельная подача патентной заявки
Расскажем, как самому подать патентную заявку: как подготовить, как оформить, куда отнести патентную заявку. Спойлер - в Федеральный институт промышленной собственности. Почему это так сложно и кто сможет помочь, узнаем на мастер-классе.
16. Ролевая игра по моделированию раздела патентной прибыли (состоится при участии не менее 15 человек)
Игра позволит молодым ученым ознакомиться с правовыми нормами, регулирующими сферу внедрения разработки и подачи патентных заявок. Рассмотрим модели поведения в конфликтной ситуации раздела полученной предприятием прибыли, на которую претендует научный институт.
17. Электрофорез белков в денатурирующих условиях
Вы познакомитесь с теоретическими и практическими основами одного из главных методов мониторинга качества очистки белков и оценки их молекулярного веса.
18. Практические навыки работы с анаэробными бактериями и археями
Расскажем об анаэробных микроорганизмах, которые хранятся и поддерживаются во Всероссийской коллекции микроорганизмов (ВКМ). Покажем технические приемы, позволяющие приготовить анаэробные среды и выращивать экстремальных анаэробов, продемонстрируем морфологию метаногенных архей.
19. ЯМР в изучении белков
В рамках мастер-класса познакомимся с возможностями спектроскопии ЯМР в исследованиях белков. Участники мастер-класса будут анализировать ЯМР-спектры белков. Мы научимся определять по спектрам – какие атомы белка участвуют в связывании лиганда. Научимся рассчитывать Кд белок-лиганд по данным ЯМР. Научимся распознавать с помощью ЯМР нативно разупорядоченные белки (IDP).
МК пройдут 22 апреля (понедельник) с 15.30 до 17.00 и 24 апреля (среда) с 12.00 до 13.30. Запись будет осуществляться ОНЛАЙН. В 20-х числах марта всем оплатившим очным участникам и слушателям на почту придет второе информационное письмо, в котором будет ссылка для записи на МК.
Наука - это круто! До встречи в Пущино!
VK: Biology21
Telegram: Biology21
Email: org.com@bioscience21.ru